В системе пестконтроля существует ряд обязательных и последовательных действий, в которых результат первых мероприятий диктует ряд последующих,  и они не могут быть изъяты из обращения или существенно  изменяться в последовательности.

Первым, исходным мероприятием является визуальное или инструментальное обследование, при котором определяют: вид вредителя, широту его распространения, угрозу его появления. При этом выявляют вероятные каналы поступления и перемещения вредителя, места обитания, питания и выплода.

Вторым действием является составление специальных рекомендаций для данной территории и строений в адрес администрации объекта по выполнению мер защиты от вредителя с указанием объемов и сроков исполнения.

Третьим этапом является организация учета: мониторинг вредителя в местах его поступления и возможного обитания специальными средствами обнаружения по усмотрению специалиста пестконтроля – поддержание сети средств обнаружения в постоянной готовности и оценка показателей численности вредителя, экологической фазы его развития и перемещений.

В числе основных особенностей работ, проводимых в системе пестконтроль, необходимо отметить следующее:

1. Организация, внедряющая у себя систему мероприятий пестконтроль, не только финансирует их, но и активно осуществляет меры по защите строений при консультации специалистов.

2. Система борьбы строится на основе проекта, разрабатываемого специалистами.

3. Проект мероприятий (программа пестконтроля) в системе пестконтроль разрабатывается индивидуально для каждого объекта с учетом местных особенностей, климата, флоры и фауны вредителей.

4. Проект включает в себя профилактические меры, которые осуществляются руководством объекта в первую очередь, обеспечивающие последующую эффективность действий по уничтожению вредителей.

5. Администрация и персонал объекта принимает активное участие (предусматриваемое проектом) в постоянном поддержании защитных мер в рабочем, действующем состоянии.

6. Специалисты по пестконтролю ведут квалифицированное наблюдение  (мониторинг) за состоянием численности и размещением видов-паразитов, совершенствуя и развивая мероприятия по профилактике и уничтожению вредителей.

7. Документация, используемая в системе пестконтроля, является инструментом для анализа ситуации и совершенствования мероприятий. В первую очередь  - это схема территории и схема помещений, на которых отмечены и занумерованы точки расположения средств контроля и средств уничтожения вредителей. Кроме того, заполняются таблицы с указанием наличия и количества вредителей, а также итоговые акты о результатах работ и эффективности мероприятий.

8. Наряду с самоконтролем (внутренний аудит), используется и внешний, независимый контроль, осуществляемый с привлечением сторонних специалистов, и ежегодно составляется отчет о проделанной работе по специальной форме. В отчете отражаются объективные данные о состоянии работы и результатах учетов, проверок с аналитическими выводами и предложениями о перспективах организации и проведения дальнейших мероприятий.

9. Все мероприятия осуществляются по программе, согласованной с администрацией объекта и при её участии в организации работ.

10. Особое внимание уделяется применению в помещениях избирательных и экологически чистых средств уничтожения вредителей, а также защите строений от поступления вредителей извне.

11. Выполнение работ в системе действий пестконтроля осуществляется специалистами, прошедшими подготовку не только в области применения дезинфекционных средств, но и по разделам экологии вредителей – видов, против которых направлены мероприятия, - с присвоением соответствующей квалификации.

12. Все средства контроля и уничтожения вредных видов используются при условии разрешения их к применению организациями Госсанэпиднадзора.